После событий второй части Алекс, Марти, Глория и Мелман все еще не могут вернуться в Нью-Йоркский зоопарк — их преследуют владельцы зоопарка и охранники, которые хотят вернуть пропавших животных. Вместе с королем Джулианом, Морисом, Мортом и командой пингвинов они вынуждены скрываться и случайно натыкаются на странствующий европейский цирк, который становится для них единственным шансом...
